抗癫痫药物的不良反应发生机制比较复杂，涉及多个系统，部分可停药而痊愈，有些可造成不可逆的损伤。用药前问清患者及家庭患病史和药物变态反应史；用药剂量正规化、合理化；用药期间定期密切观察患者用药后情况监测患者各项生理指标，条件具备时应定期对患者进行血药浓度监测；由于该类药物之间或与其他治疗药物之间相互作用较多，应尽量减少合并用药；出现不良反应，应采取相应措施给予治疗。主要有：
1皮肤损害
皮疹为抗癫痫药物引起的常见的不良反应，苯妥英钠、苯巴比妥、卡马西平、拉莫三嗪等均可引起皮疹，多数为良性皮疹，少数为严重皮肤损害。卡马西平、苯巴比妥、苯妥英钠、拉莫三嗪等可致Stevenes-Johnson综合征，严重者可引起死亡。
2血液系统损害
血液系统不良反应在抗癫痫药物中常有报道，如再生障碍性贫血、血小板减少、全血细胞减少、白细胞减少等。
3中枢及神经系统不良反应
中枢神经系统常见的不良反应为头晕、头痛、头昏、乏力、疲劳、注意力不集中等，但症状不明显，对正常生活、学习无明显影响，多为一过性，随着服药时间的延长或减量后症状缓解。
4心血管系统的不良反应
卡马西平、苯妥英钠、拉莫三嗪、苯巴比妥等引起的心血管系统的不良反应的表现有心律失常，如窦性心动过缓、窦性停博、频发室性早搏、阿斯综合征等。
5消化系统的不良反应
抗癫痫药物引起消化系统的不良反应为严重肝功异常、慢性胰腺炎、胃出血、食管气管瘘等。
6内分泌的不良反应
主要表现为男性乳房发育、闭经、溢乳等。其机制可能与下列因素有关：诱导肝微粒体酶加速激素的代谢；下丘脑和或垂体前叶功能受干扰；抗癫痫药物对内分泌腺的直接影响。
7淋巴系统的不良反应
主要的不良反应为淋巴结肿大、假性淋巴瘤综合征、淋巴瘤等。
8全身性损害
主要表现为多系统损害、发热、死亡等。
9其他
抗癫痫药物还可引起癫痫恶化、胎儿死亡、低钠血症、胎儿畸形等不良反应。几乎所有抗癫痫药物都有潜在致畸作用，联合用药危险性更大。
